Table 4 Second-line drug resistance by study site and treatment history
Study site | Treatment history | Second-line drug resistance amongst MDR | Total MDR with second-line DST done | Pre-XDR drug resistance profiles of MDR isolates | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Susceptible | Pre-XDR | Fluoroquinolones | Injectables | ||||||||||||
OFX | KAN | CAP | KAN/CAP | ||||||||||||
N | % | n | % | n | % | n | % | n | % | n | % | ||||
Burkina Faso | All | Â | 1 | (100) | 0 | (0) | 1 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) |
New | – | – | – | – | 0 | – | – | – | – | – | – | – | – | ||
Retreatment | 1 | (100) | 0 | (0) | 1 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
The Gambia | All | Â | 9 | (75) | 3 | (25) | 12 | 0 | (0) | 0 | (0) | 2 | (17) | 1 | (8) |
New | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Retreatment | 9 | (75) | 3 | (25) | 12 | 0 | (0) | 0 | (0) | 2 | (17) | 1 | (8) | ||
Ghana | All | Â | 20 | (61) | 13 | (39) | 33 | 3 | (9) | 2 | (6) | 7 | (21) | 1 | (3) |
New | 0 | (0) | 2 | (100) | 2 | 0 | (0) | 2 | (100) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Retreatment | 20 | (65) | 11 | (35) | 31 | 3 | (10) | 0 | (0) | 7 | (23) | 1 | (3) | ||
Guinea-Bissau | All | Â | 1 | (100) | 0 | (0) | 1 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) |
New | 1 | (100) | 0 | (0) | 1 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Retreatment | – | – | – | – | 0 | – | – | – | – | – | – | – | – | ||
Mali | All | Â | 30 | (79) | 8 | (21) | 38 | 1 | (3) | 1 | (3) | 5 | (13) | 1 | (3) |
New | 5 | (100) | 0 | (0) | 5 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Retreatment | 25 | (76) | 8 | (24) | 33 | 1 | (3) | 1 | (3) | 5 | (16) | 1 | (3) | ||
Nigeria/Ibadan | All | Â | 13 | (76) | 4 | (23) | 17 | 2 | (12) | 0 | (0) | 2 | (12) | 0 | (0) |
New | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Retreatment | 13 | (76) | 4 | (23) | 17 | 2 | (12) | 0 | (0) | 2 | (12) | 0 | (0) | ||
Nigeria/Lagos | All | Â | 59 | (91) | 6 | (9) | 65 | 6 | (9) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) |
New | 8 | (100) | 0 | (0) | 8 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Retreatment | 51 | (89) | 6 | (11) | 57 | 6 | (10) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Senegal | All | Â | 5 | (100) | 0 | (0) | 5 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) |
New | 2 | (100) | 0 | (0) | 2 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Retreatment | 3 | (100) | 0 | (0) | 3 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | ||
Togo | All | Â | 20 | (74) | 7 | (26) | 27 | 1 | (4) | 1 | (4) | 3 | (11) | 2 | (7) |
New | 2 | (40) | 3 | (60) | 5 | 1 | (20) | 0 | (0) | 1 | (20) | 1 | (20) | ||
Retreatment | 18 | (82) | 4 | (18) | 22 | 0 | (0) | 1 | (4) | 2 | (9) | 1 | (4) | ||
All study sites | All | Â | 158 | (79) | 41 | (21) | 199 | 12 | (6) | 4 | (2) | 19 | (9) | 6 | (3) |
New | 18 | (78) | 5 | (22) | 23 | 1 | (4) | 2 | (9) | 1 | (4) | 1 | (4) | ||
Retreatment | 140 | (80) | 36 | (20) | 176 | 11 | (6) | 2 | (1) | 18 | (10) | 5 | (3) | ||