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Table 1 Clinicopathological characteristics and subtype distribution of the combined cohort evaluated in this study

From: Response and survival of breast cancer intrinsic subtypes following multi-agent neoadjuvant chemotherapy

  GSE41998 [21] % GSE25066 [19] % GSE32646 [20] % GSE22226 [22] % TOTAL %
N 279 508 115 55 957
Age, years (mean) 49 50 51 49 50
Tumor size           
 T0-T2 177 64.1 % 288 56.7 % 92 80 % 27 50.0 % 584 61.3 %
 T3-T4 99 35.9 % 220 43.3 % 23 20 % 27 50.0 % 369 38.7 %
ER IHC status           
 Positive 108 38.7 % 297 59.2 % 71 62 % 31 58.5 % 507 53.4 %
 Negative 171 61.3 % 205 40.8 % 44 38 % 22 41.5 % 442 46.6 %
PR IHC status           
 Positive 99 35.6 % 243 48.5 % 45 39 % 21 39.6 % 408 43.1 %
 Negative 179 64.4 % 258 51.5 % 70 61 % 32 60.4 % 539 56.9 %
Triple-negative status           
 No 139 49.8 % 330 65.0 % 89 77 % 47 88.7 % 605 63.4 %
 Yes 140 50.2 % 178 35.0 % 26 23 % 6 11.3 % 350 36.6 %
HER2 IHC/FISH status           
 Negative 251 90.0 % 485 98.8 % 81 70 % 24 49.0 % 841 90.0 %
 Positive 28 10.0 % 6 1.2 % 34 30 % 25 51.0 % 93 10.0 %
Histological grade           
 1 32 6.8 % 16 13.9 % 2 3.6 % 50 14.9 %
 2 180 38.2 % 78 67.8 % 27 49.1 % 285 48.2 %
 3 259 55.0 % 21 18.3 % 26 47.3 % 306 51.8 %
Nodal status           
 N0 157 31 % 32 28 % 189 30.3 %
 N1-3 351 69 % 83 72 % 434 69.7 %
pCR rate           
 No 184 72.7 % 389 79.7 % 88 77 % 37 68.5 % 698 76.7 %
 Yes 69 27.3 % 99 20.3 % 27 23 % 17 31.5 % 212 23.3 %
PAM50           
 Luminal A 91 32.6 % 155 30.5 % 30 26 % 17 30.9 % 293 30.6 %
 Luminal B 33 11.8 % 109 21.5 % 23 20 % 9 16.4 % 174 18.2 %
 HER2-E 23 8.2 % 40 7.9 % 24 21 % 12 21.8 % 99 10.3 %
 Basal-like 110 39.4 % 171 33.7 % 21 18 % 11 20.0 % 313 32.7 %
 Normal-like 22 7.9 % 33 6.5 % 17 15 % 6 10.9 % 78 8.2 %
  1. HER2-E, HER2-enriched; pCR, Pathological complete response; ER, Estrogen receptor; PR, Progesterone receptor; IHC, Immunohistochemistry